制藥廢水的形成主要來源于四種生產類型：抗生素的生產、中成藥的生產、合成藥物的生產、各類醫藥劑的洗滌水。廢水成分多較為復雜，有機污染物類別繁多，主要包括生產過程中各類的原料和溶劑，伴隨著各種化學反應和副產物的形成，廢水的濃度較高，毒性較大，形成的顏色較深，生物降解極其困難。例如生產抗生素環丙沙星過程發酵廢水、中間體廢水即為難降解、有毒性廢水，這種廢水成分抑制微生物分解作用，同時也增加了處理成本。

1厭氧處理法：厭氧氧化法一般用來處理濃度較高的有機制廢水，單獨的厭氧處理后，出水COD含量仍然會很高，因此處理時會以好氧生物處理作為后處理，達到較好的效果。比較典型的技術有上流式厭氧污泥床法(UASB法)，又稱作流式厭氧污泥床。結構原理是將反應器底部設置高活性、高濃度的污泥床，污水逆流經過后，會經過厭氧發酵為甲烷(CH4)和二氧化碳(CO2)。